Virüsün vücutta nasıl yayıldığını gözlemlemeye yönelik yeni yöntem

Kovid-19 hastalığına neden olan SARS-CoV-2 virüsünün hayvan hücrelerinde ve dokularında gözlemlenebilir şekilde parlaması sağlandı. Böylece viral enfeksiyonun yayılmasını ve şiddetini gözlemlemenin yeni bir yolu bulunmuş oldu.

ABD’deki Teksas Biyomedikal Araştırma Enstitüsü’nden araştırmacıların bu başarısına ilişkin makaleye, Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS) dergisinin 12 Ekim’de yayınlanacak sayısında yer verilmesi bekleniyor.

Texas Üniversitesi’nden, makalenin başyazarı olan Profesör Luis Martinez Sobredo, üniversitenin internet sitesinde pazartesi günü yayınlanan raporda şu ifadeleri kullandı:

“Artık Kovid-19’un hayvan modellerinde yayılırken izlediği yolu gözlemleyebiliriz. Virüsün nasıl ilerlediğini ve özellikle hangi organları ve hücre tiplerini hedeflediğini görüyor olmak, virüsün anlaşılması ile antiviral ilaçların ve aşıların geliştirilmesi açısından çok büyük bir yardım sağlayacak.”

Sobredo ve ekibi ‘raporcu virüs’ olarak adlandırılan değiştirilmiş virüsü, endişe verici varyantlara karşı antikorları nötralize etme açısından ne kadar iyi çalışabileceğini incelediler.

Sobredo ve ekibi raporcu virüsü geliştirmek amacıyla virüsün genetik koduna floresan proteinlerin genetik dizisini eklemek için birkaç gelişmiş moleküler biyoloji aracını birleştirdiler. Böylece virüs ile birlikte floresan proteinler de kopyalanabildi.

Ekip daha önceki bir çalışmada, virüsün genlerinden birini floresan protein geni ile değiştirmiş ancak zayıf sinyal alabilmişti. Zira söz konusu genler, hayvanlarda kolayca tespit edilebilecek kadar floresan sağlamamıştı. Araştırmacılar daha sonra, parlaklığı artırmak için virüsün daha fazla miktarda floresan protein üretmesini nasıl sağlayacaklarını çözmek için çalışmalara başladılar. Buldukları çözüm, SARS-CoV-2’deki farklı bir genin -tam olarak nükleokapsid proteinini kodlayan gen- yanına raporcu bir gen yerleştirmeleri oldu. Sobredo Martinez laboratuvarında çalışan Chengjin Ye “Virüste en gözlemlenebilir olan şey proteinlerdir. Bu sefer görüntü son derece parlaktı. Mikroskoptan baktığımda neredeyse ışıktan kör oluyordum” açıklamasında bulundu.

Raporcu proteinler, proteinlerin yaydığı ışığın dalga boylarını tespit eden görüntüleme sistemleriyle birlikte hücrelerde ve canlı hayvan modellerinde gözlemlenebiliyor. Viral yükünün ve konumunun görsel olarak gözlemlenebilmesi, diğer yöntemlere kıyasla birçok avantaj sunuyor. Ayrıca bu yöntem çok daha basit ve hızlı gerçekleşmesi nedeniyle zaman ve araç tasarrufu da sağlıyor.

Chengjin Ye, konuya dair şunları söyledi:

“Çalışıp çalışmadıklarını öğrenmek için 2 bin bileşiği test edecek büyük bir ekip görevlendirmek yerine bir kişi bunu raporcu virüslerle sadece birkaç saat içinde yapabilir. Aynı zamanda virüsün enfeksiyon ve tedavi sürecinin aynı hayvanda izlenmesini sağlayarak, benzer gözlemler için gerekli olan hayvanların sayısı da azaltılabilir.”

Ekip, SARS-CoV-2 virüsünün varyantları ile bağlantılı olan farklı renklerdeki proteinleri oluşturmak için raporcu virüsleri değiştirdi. Bu çalışmalar tek bir testte, aynı anda iki varyanta karşı nötralize edici antikorun ne kadar iyi çalıştığını gözlemlemelerini sağladı. Martinez Sobredo’nun laboratuvarından Kevin Shim gelimeye dair şu açıklamada bulundu:

“Bu, özellikle de pandemi nedeniyle bu kadar yüksek talep ve sınırlı tedarikin söz konusu olduğu bir dönemde, plastik ve reaktif gibi birçok temel malzemenin yanı sıra zamandan ve kaynaklardan tasarruf edilmesi açısından önemli. Ayrıca bu sistem, yeni varyantlar ortaya çıktıkça kolayca uyarlanabiliyor. Böylece antikorların yeni varyantlara karşı ne kadar etkili olduğunu hızlı bir şekilde tespit edebiliyoruz.”

Araştırma grubunun raporu, virüslerin orijinal versiyonuyla aynı şekilde davrandığını gösterdi. Bu durum, araştırmacıların virüsten herhangi bir viral geni çıkarmamış olmaları ve raporcu proteini, virüsün nükleokapsid proteininden hemen ayrılacak şekilde tasarlamaları dolayısıyla mümkün oldu.(Şarku’l Avsat)

Kâbusun yeni adı: Kovid ağrısı

Kovid-19 tedbirleri protesto edildi, polis müdahale etti

Kovid-19 ile mücadelede güzel haber! Delta varyantında da etkili